28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1764 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1764  lipase chaperone  100 
 
 		 352 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2291  lipase chaperone  33.23 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2565  lipase chaperone  30.41 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18618  hitchhiker  0.000000000061931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27090  lipase chaperone  32.98 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1143  lipase chaperone  26.59 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5358  lipase chaperone  31.19 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0738  lipase chaperone  30.72 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.942726  normal  0.612354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3294  lipase chaperone  33.46 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0808  lipase chaperone  29.57 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4450  lipase chaperone  31.95 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3916  lipase chaperone  31.95 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.831951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3611  lipase chaperone  31.95 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0969  lipase chaperone  28.32 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3810  lipase chaperone  33.09 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.492259  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2172  lipase chaperone  31.2 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0157769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0444  lipase chaperone  28.71 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3795  lipase chaperone  31.64 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1808  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2504  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0429  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0479  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2365  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0818  lipase chaperone  30.71 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0640  lipase chaperone  29.77 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3357  lipase chaperone  27.35 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4190  lipase chaperone-like protein  31.72 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4667  lipase chaperone  30.12 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0463  lipase chaperone  24.57 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0312801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>