17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4851 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  98.88 
 
 		 357 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 357 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  69.64 
 
 		 361 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  65.75 
 
 		 391 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  53.39 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  46.39 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  45.02 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  43.67 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  43.27 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  40.17 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  38.36 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  39.4 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  38.35 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  28.54 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.72 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.21 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1030 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>