14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1294 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  885    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  44.75 
 
 
385 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  41.34 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  42.17 
 
 
371 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  42.19 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  38.54 
 
 
361 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  39.27 
 
 
391 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  41.43 
 
 
390 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  38.92 
 
 
357 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  38.87 
 
 
361 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  38.35 
 
 
357 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  38.4 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  38.8 
 
 
361 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  30.55 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>