15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0789 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  46.39 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  46.39 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  46.13 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  45.35 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  43.15 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  43.24 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  41.78 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  41.16 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  42.21 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  39.66 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  42.19 
 
 		 443 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  39.83 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.05 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>