14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0647 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  740    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  62.4 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  55.68 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  46.82 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  45.81 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  44.55 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  41.82 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  40.17 
 
 		 357 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  40.17 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  45.07 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  41.16 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  41.34 
 
 		 443 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  38.25 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  32.76 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>