14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6608 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  42.9 
 
 		 385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  45.54 
 
 		 377 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  42.36 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  40.95 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  41.79 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  41.13 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  41.19 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  41.05 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  41.43 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  40.84 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  38.62 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  39.08 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  31.46 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>