16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4334 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  98.88 
 
 		 357 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  69.36 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  65.21 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  53.39 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  46.39 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  45.02 
 
 		 361 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  43.07 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  43.57 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  40.17 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  37.74 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  38.92 
 
 		 443 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  29.02 
 
 		 421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.72 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1030 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>