16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3034 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  734    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0647  hypothetical protein  56.05 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1390  hypothetical protein  54.24 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000676729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3253  hypothetical protein  46.61 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0789  hypothetical protein  46.69 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5340  hypothetical protein  46.2 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5305  hypothetical protein  47.27 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1897  hypothetical protein  43.25 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000359391  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4334  hypothetical protein  43.57 
 
 		 357 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.72153  normal  0.0216853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4851  NHL repeat-containing protein  43.27 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0728414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1294  hypothetical protein  42.33 
 
 		 443 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6608  hypothetical protein  42.07 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1386  hypothetical protein  40.31 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.473067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0927  hypothetical protein  32.99 
 
 		 421 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3893  hypothetical protein  63.64 
 
 		 228 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3332  hypothetical protein  67.65 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.663961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>