107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0129 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0543  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.25 
 
 		 464 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3127  putative ethanolamine ammonia-lyase heavy chain protein  76.29 
 
 		 464 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.978447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0727  ethanolamine ammonia-lyase, heavy subunit  75 
 
 		 464 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2983  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  92.15 
 
 		 446 aa  817    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0628  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.45 
 
 		 464 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5490  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  76.65 
 
 		 460 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0141  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.47 
 
 		 465 aa  851    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4991  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  72.57 
 
 		 464 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1380  Ethanolamine ammonia-lyase  75.34 
 
 		 459 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3309  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  96.34 
 
 		 465 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3282  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.26 
 
 		 465 aa  879    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0586  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.78 
 
 		 465 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0654088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1711  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.82 
 
 		 460 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175547  normal  0.0679965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4444  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  87.28 
 
 		 464 aa  834    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1073  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.15 
 
 		 466 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2981  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.49 
 
 		 464 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal  0.119389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5902  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  74.02 
 
 		 460 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2926  ethanolamine ammonia lyase large subunit  97.42 
 
 		 465 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.238686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1427  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.67 
 
 		 467 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0119  ethanolamine ammonia lyase large subunit  99.35 
 
 		 465 aa  943    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11770  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  72.95 
 
 		 464 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  97.42 
 
 		 465 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0276  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.89 
 
 		 466 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2941  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.25 
 
 		 467 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4774  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.99 
 
 		 462 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2626  ethanolamine ammonia lyase large subunit  72 
 
 		 465 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3323  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.15 
 
 		 446 aa  817    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2417  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  71.65 
 
 		 469 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1555  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.15 
 
 		 446 aa  817    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3939  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.69 
 
 		 465 aa  855    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.869476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4011  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.26 
 
 		 465 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3047  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  92.15 
 
 		 446 aa  817    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2682  ethanolamine ammonia lyase large subunit  75.73 
 
 		 464 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0582  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.25 
 
 		 464 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.892801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1082  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  72.95 
 
 		 464 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4034  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.81 
 
 		 462 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3436  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.01 
 
 		 461 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  hitchhiker  0.000159598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2260  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.86 
 
 		 463 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0127  ethanolamine ammonia lyase large subunit  94.62 
 
 		 465 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379355  normal  0.56041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1952  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.72 
 
 		 460 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0588  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.25 
 
 		 464 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3531  ethanolamine ammonia lyase large subunit  72.25 
 
 		 460 aa  675    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0595  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.24 
 
 		 464 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0143  ethanolamine ammonia lyase large subunit  96.99 
 
 		 465 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0847  ethanolamine ammonia lyase large subunit  72.22 
 
 		 459 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.35048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2801  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.05 
 
 		 473 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0519185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  100 
 
 		 465 aa  949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0007  ethanolamine ammonia lyase large subunit  83.62 
 
 		 464 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4309  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  75.55 
 
 		 460 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0021  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  87.5 
 
 		 464 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1907  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.59 
 
 		 460 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4270  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.99 
 
 		 460 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2413  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  76.16 
 
 		 462 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.451025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2228  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.72 
 
 		 460 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1382  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.72 
 
 		 459 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09920  Ethanolamine ammonia lyase, large subunit  72.22 
 
 		 464 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3276  Ethanolamine ammonia-lyase  71.05 
 
 		 464 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4419  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  75.55 
 
 		 460 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.907158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2764  Ethanolamine ammonia-lyase  71.01 
 
 		 458 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.010838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2927  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.75 
 
 		 452 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000714  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  68.13 
 
 		 470 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3053  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  68.24 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.900689  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1032  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  69.25 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3739  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.69 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0477  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.34 
 
 		 473 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1717  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.47 
 
 		 460 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133607  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0065  ethanolamine ammonia lyase large subunit  65.71 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8500  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.82 
 
 		 465 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6287  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  67.04 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2369  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.49 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1253  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.96 
 
 		 452 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000695585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1783  Ethanolamine ammonia-lyase  65.84 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0371427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3197  ethanolamine ammonia lyase large subunit  65.3 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00826129  normal  0.498798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21500  Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  66.74 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2932  Ethanolamine ammonia-lyase  64.01 
 
 		 469 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3631  Ethanolamine ammonia-lyase  64.16 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.963165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1847  Ethanolamine ammonia-lyase  66.96 
 
 		 481 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3314  ethanolamine ammonia lyase large subunit  64.6 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4843  Ethanolamine ammonia-lyase  63.5 
 
 		 470 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2577  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  62.95 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2264  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  68.92 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0891  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.91 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2646  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.79 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0070  Ethanolamine ammonia-lyase  55.14 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1054  Ethanolamine ammonia-lyase  53.52 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1295  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.99 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02341  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit, heavy chain  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1220  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4034  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  54.27 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.680075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2578  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2727  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1238  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.357696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2596  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2816  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2651  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2718  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547014  normal  0.753357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2692  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.20619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2603  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  53.02 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2825  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  52.93 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02303  hypothetical protein  53.02 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>