107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0628 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0543  ethanolamine ammonia lyase large subunit  90.09 
 
 		 464 aa  868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3127  putative ethanolamine ammonia-lyase heavy chain protein  78.02 
 
 		 464 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.978447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0727  ethanolamine ammonia-lyase, heavy subunit  98.28 
 
 		 464 aa  947    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2983  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  74.42 
 
 		 446 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0628  ethanolamine ammonia lyase large subunit  100 
 
 		 464 aa  958    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5490  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  70.13 
 
 		 460 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0141  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  73.17 
 
 		 465 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4991  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  90.06 
 
 		 464 aa  878    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1380  Ethanolamine ammonia-lyase  71.78 
 
 		 459 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3309  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  73.45 
 
 		 465 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1032  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  68.11 
 
 		 463 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3282  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  72.28 
 
 		 465 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0586  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.19 
 
 		 465 aa  727    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0654088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1711  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66 
 
 		 460 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175547  normal  0.0679965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4444  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  74.31 
 
 		 464 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2981  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.58 
 
 		 464 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal  0.119389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5902  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  71 
 
 		 460 aa  680    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2926  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.67 
 
 		 465 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.238686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1427  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.13 
 
 		 467 aa  670    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3053  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  70.34 
 
 		 451 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.900689  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0119  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.67 
 
 		 465 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11770  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  89.87 
 
 		 464 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.67 
 
 		 465 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0276  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.57 
 
 		 466 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2941  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.83 
 
 		 467 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4774  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  65.65 
 
 		 462 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2626  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.35 
 
 		 465 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3323  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  74.42 
 
 		 446 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2417  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  71.31 
 
 		 469 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1555  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  74.42 
 
 		 446 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3939  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  73.39 
 
 		 465 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.869476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4011  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  73.17 
 
 		 465 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3047  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  74.42 
 
 		 446 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2682  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.62 
 
 		 464 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0582  ethanolamine ammonia lyase large subunit  90.09 
 
 		 464 aa  869    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.892801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0477  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.78 
 
 		 473 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1082  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  89.66 
 
 		 464 aa  877    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4034  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.13 
 
 		 462 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3436  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.85 
 
 		 461 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  hitchhiker  0.000159598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2260  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.71 
 
 		 463 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0127  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.67 
 
 		 465 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379355  normal  0.56041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0588  ethanolamine ammonia lyase large subunit  90.09 
 
 		 464 aa  872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3531  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.37 
 
 		 460 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0595  ethanolamine ammonia lyase large subunit  90.3 
 
 		 464 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0143  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.67 
 
 		 465 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2801  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.09 
 
 		 473 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0519185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.45 
 
 		 465 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0007  ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.31 
 
 		 464 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4309  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.15 
 
 		 460 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0021  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.08 
 
 		 464 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4270  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.55 
 
 		 460 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2413  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  75.32 
 
 		 462 aa  725    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.451025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1253  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  74.11 
 
 		 452 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000695585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8500  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.34 
 
 		 465 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09920  Ethanolamine ammonia lyase, large subunit  80.39 
 
 		 464 aa  795    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3276  Ethanolamine ammonia-lyase  68.11 
 
 		 464 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4419  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.15 
 
 		 460 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.907158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2764  Ethanolamine ammonia-lyase  69.89 
 
 		 458 aa  661    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.010838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2927  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.4 
 
 		 452 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000714  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.75 
 
 		 470 aa  666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3739  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.42 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1717  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.55 
 
 		 460 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133607  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1952  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.89 
 
 		 460 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2228  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.12 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1907  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.89 
 
 		 460 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1382  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.43 
 
 		 459 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1073  ethanolamine ammonia lyase large subunit  63.56 
 
 		 466 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3197  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.15 
 
 		 469 aa  614  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00826129  normal  0.498798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0065  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.22 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6287  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  65.47 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2932  Ethanolamine ammonia-lyase  66.82 
 
 		 469 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0847  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.82 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.35048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1783  Ethanolamine ammonia-lyase  64.35 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0371427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21500  Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.27 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2369  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.44 
 
 		 459 aa  596  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3631  Ethanolamine ammonia-lyase  62.72 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4843  Ethanolamine ammonia-lyase  61.11 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2577  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  61.52 
 
 		 458 aa  565  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1847  Ethanolamine ammonia-lyase  63.74 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2264  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  65.85 
 
 		 466 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3314  ethanolamine ammonia lyase large subunit  60.65 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0891  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  52.17 
 
 		 455 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1295  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.23 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4034  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.07 
 
 		 455 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.680075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0070  Ethanolamine ammonia-lyase  51.47 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2646  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.72 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1054  Ethanolamine ammonia-lyase  52.2 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02341  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit, heavy chain  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1220  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2578  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2727  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1238  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.357696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2596  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2816  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2651  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2718  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547014  normal  0.753357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2692  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.20619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2603  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2825  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.9 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02303  hypothetical protein  50.9 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>