106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2651 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02341  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit, heavy chain  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1220  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1240  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.09 
 
 
454 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2578  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2727  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1238  ethanolamine ammonia lyase large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.357696  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2596  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2816  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  98.01 
 
 
453 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2651  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  100 
 
 
453 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2718  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  99.78 
 
 
453 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547014  normal  0.753357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2692  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  99.78 
 
 
453 aa  933    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.20619  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2603  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  100 
 
 
453 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2825  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  99.78 
 
 
453 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3671  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  97.57 
 
 
453 aa  915    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02303  hypothetical protein  98.01 
 
 
453 aa  924    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0070  Ethanolamine ammonia-lyase  64.16 
 
 
453 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1054  Ethanolamine ammonia-lyase  63.36 
 
 
454 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1295  ethanolamine ammonia lyase large subunit  59.51 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0891  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  61.23 
 
 
455 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4034  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  58.06 
 
 
455 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.680075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2646  ethanolamine ammonia lyase large subunit  59.03 
 
 
454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4861  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  55.09 
 
 
454 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0007  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.63 
 
 
464 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4444  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.86 
 
 
464 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0021  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.63 
 
 
464 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0119  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.02 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3309  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.03 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3282  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  51.8 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2926  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.91 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.238686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.91 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2941  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.77 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.02 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0586  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.51 
 
 
465 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0654088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3531  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.64 
 
 
460 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346305  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2801  ethanolamine ammonia lyase large subunit  49.78 
 
 
473 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0519185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2927  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.77 
 
 
452 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1427  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.4 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0276  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.07 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2626  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.98 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190636  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1783  Ethanolamine ammonia-lyase  51.7 
 
 
465 aa  458  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0371427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0065  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.6 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5902  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  51.04 
 
 
460 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0595  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.93 
 
 
464 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0543  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.93 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0727  ethanolamine ammonia-lyase, heavy subunit  50.68 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0628  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.9 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4991  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  51.47 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0582  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.7 
 
 
464 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.892801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2260  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.19 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1952  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0588  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.7 
 
 
464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.217463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0143  ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.14 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2228  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000714  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.57 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0141  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  52.03 
 
 
465 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3053  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  50.34 
 
 
451 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.900689  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2417  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  51.69 
 
 
469 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3939  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  51.8 
 
 
465 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.869476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4011  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  51.8 
 
 
465 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2682  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.13 
 
 
464 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0127  ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.85 
 
 
465 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379355  normal  0.56041 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4309  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.23 
 
 
460 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1907  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  49.32 
 
 
460 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1253  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  53.21 
 
 
452 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4419  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.23 
 
 
460 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.907158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2981  ethanolamine ammonia lyase large subunit  49.45 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal  0.119389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11770  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  49.78 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4774  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  49.22 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1082  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  49.77 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4034  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.34 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2413  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.83 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.451025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1382  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  52.58 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3276  Ethanolamine ammonia-lyase  50.45 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1380  Ethanolamine ammonia-lyase  50.45 
 
 
459 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3739  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  50.57 
 
 
462 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5490  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  49.11 
 
 
460 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0847  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.41 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.35048  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09920  Ethanolamine ammonia lyase, large subunit  50.11 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2764  Ethanolamine ammonia-lyase  49.33 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.010838 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2983  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.71 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3323  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  52.71 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1555  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  52.71 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3047  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  52.71 
 
 
446 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0477  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.68 
 
 
473 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8500  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  49.55 
 
 
465 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4843  Ethanolamine ammonia-lyase  48.68 
 
 
470 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3127  putative ethanolamine ammonia-lyase heavy chain protein  51.32 
 
 
464 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.978447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1073  ethanolamine ammonia lyase large subunit  48.12 
 
 
466 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3631  Ethanolamine ammonia-lyase  47.99 
 
 
470 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1711  ethanolamine ammonia lyase large subunit  47.87 
 
 
460 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175547  normal  0.0679965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4270  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.23 
 
 
460 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6287  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  48.73 
 
 
465 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1032  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  48.75 
 
 
463 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1717  ethanolamine ammonia lyase large subunit  49.89 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133607  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3197  ethanolamine ammonia lyase large subunit  47.73 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00826129  normal  0.498798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2264  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  52.06 
 
 
466 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3436  ethanolamine ammonia lyase large subunit  48.45 
 
 
461 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  hitchhiker  0.000159598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2369  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  47.52 
 
 
459 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21500  Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  47.66 
 
 
460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1847  Ethanolamine ammonia-lyase  48.97 
 
 
481 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>