107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3276 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0543  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.12 
 
 		 464 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0727  ethanolamine ammonia-lyase, heavy subunit  67.68 
 
 		 464 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2983  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  72.09 
 
 		 446 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0628  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.11 
 
 		 464 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5490  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  69.37 
 
 		 460 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0141  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  71.27 
 
 		 465 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4991  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.17 
 
 		 464 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1380  Ethanolamine ammonia-lyase  67.69 
 
 		 459 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3309  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  71.4 
 
 		 465 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3282  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  69.68 
 
 		 465 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1717  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.98 
 
 		 460 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133607  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0586  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.37 
 
 		 465 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0654088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1711  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.26 
 
 		 460 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175547  normal  0.0679965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4444  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  70.64 
 
 		 464 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1073  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.06 
 
 		 466 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2981  ethanolamine ammonia lyase large subunit  84.63 
 
 		 464 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal  0.119389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5902  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  68.71 
 
 		 460 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2926  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.27 
 
 		 465 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.238686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1427  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.12 
 
 		 467 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0119  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.49 
 
 		 465 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11770  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  67.97 
 
 		 464 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.27 
 
 		 465 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0276  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.04 
 
 		 466 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2941  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.87 
 
 		 467 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4774  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  75.7 
 
 		 462 aa  719    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2626  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.69 
 
 		 465 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3323  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  72.09 
 
 		 446 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1555  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  72.09 
 
 		 446 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3939  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  71.05 
 
 		 465 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.869476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4011  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  71.05 
 
 		 465 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3047  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  72.09 
 
 		 446 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2682  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.87 
 
 		 464 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0582  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.12 
 
 		 464 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.892801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1082  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  67.97 
 
 		 464 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4034  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.35 
 
 		 462 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3436  ethanolamine ammonia lyase large subunit  73.84 
 
 		 461 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  hitchhiker  0.000159598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0127  ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.95 
 
 		 465 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379355  normal  0.56041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1952  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.1 
 
 		 460 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0588  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.12 
 
 		 464 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3531  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.09 
 
 		 460 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0595  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.9 
 
 		 464 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0143  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.71 
 
 		 465 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2801  ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.81 
 
 		 473 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0519185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0129  ethanolamine ammonia lyase large subunit  71.05 
 
 		 465 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0007  ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.61 
 
 		 464 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4309  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.32 
 
 		 460 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0021  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.42 
 
 		 464 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1907  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.97 
 
 		 460 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4270  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.91 
 
 		 460 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2413  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  68.82 
 
 		 462 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.451025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2228  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.32 
 
 		 460 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6287  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  67.48 
 
 		 465 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09920  Ethanolamine ammonia lyase, large subunit  69.66 
 
 		 464 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3276  Ethanolamine ammonia-lyase  100 
 
 		 464 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4419  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  69.32 
 
 		 460 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.907158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2764  Ethanolamine ammonia-lyase  69.06 
 
 		 458 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.010838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000714  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  68.49 
 
 		 470 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2260  ethanolamine ammonia lyase large subunit  64.57 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2417  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.74 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3127  putative ethanolamine ammonia-lyase heavy chain protein  71.91 
 
 		 464 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.978447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1032  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  67.83 
 
 		 463 aa  624  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0477  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.96 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1382  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.94 
 
 		 459 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2927  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.71 
 
 		 452 aa  621  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0065  ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.15 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1253  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  70.77 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000695585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8500  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  66.45 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0847  ethanolamine ammonia lyase large subunit  67.33 
 
 		 459 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.35048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1783  Ethanolamine ammonia-lyase  63.5 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0371427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3197  ethanolamine ammonia lyase large subunit  63.68 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00826129  normal  0.498798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2369  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  65.35 
 
 		 459 aa  599  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3053  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  65.22 
 
 		 451 aa  597  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.900689  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3739  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  63.74 
 
 		 462 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21500  Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  65.24 
 
 		 460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2932  Ethanolamine ammonia-lyase  62.39 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3631  Ethanolamine ammonia-lyase  63.41 
 
 		 470 aa  571  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4843  Ethanolamine ammonia-lyase  63.84 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2577  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  61.66 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1847  Ethanolamine ammonia-lyase  63.76 
 
 		 481 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2264  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  63.38 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3314  ethanolamine ammonia lyase large subunit  62.47 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0070  Ethanolamine ammonia-lyase  51.82 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0891  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  51 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1295  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.95 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2646  ethanolamine ammonia lyase large subunit  51.69 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4034  ethanolamine ammonia-lyase heavy chain  51.12 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.680075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1054  Ethanolamine ammonia-lyase  50.33 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02341  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit, heavy chain  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1220  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2578  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2727  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1238  ethanolamine ammonia lyase large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.357696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2596  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2816  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2651  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.45 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2718  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.45 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547014  normal  0.753357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2692  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.45 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.20619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2603  ethanolamine ammonia-lyase, large subunit  50.45 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2825  ethanolamine ammonia-lyase large subunit  50.45 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02303  hypothetical protein  50.23 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>