48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2820 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2820  carotenoid 9,10-9,10 cleavage dioxygenase, putative  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  91.14 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  88.61 
 
 		 443 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  74.68 
 
 		 443 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  72.15 
 
 		 445 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  72.15 
 
 		 445 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  72.15 
 
 		 445 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  69.62 
 
 		 445 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  70.89 
 
 		 445 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  50 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  50.63 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  45.83 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  41.89 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  41.89 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  44.68 
 
 		 467 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  43.66 
 
 		 451 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  40.54 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  43.66 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  32.04 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  33.52 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  47.83 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  43.66 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  45.07 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  47.83 
 
 		 467 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  39.02 
 
 		 463 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  41.18 
 
 		 765 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  46.38 
 
 		 467 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  47.83 
 
 		 467 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  42.25 
 
 		 479 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  43.66 
 
 		 461 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  30.69 
 
 		 487 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  30.69 
 
 		 487 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  44 
 
 		 487 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  34.04 
 
 		 464 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  42.25 
 
 		 469 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  33.96 
 
 		 477 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  34.51 
 
 		 478 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  32.77 
 
 		 481 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  36.11 
 
 		 479 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  38.36 
 
 		 460 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  37.76 
 
 		 498 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  40 
 
 		 473 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  38.89 
 
 		 464 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>