113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0014 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0013  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1390  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0032  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309183  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.609025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309275  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309359  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0043  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0006  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.981742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt25  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.552192 
 
 
-
 
NC_002950  PGt26  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0005  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309086  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309117  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309161  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt024  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000181735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt16  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt16  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.61738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0028  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.696434  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309094  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.220954  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309096  tRNA-Pro  100 
 
 		 69 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.185  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309128  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309194  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309294  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309169  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05971  hypothetical protein  100 
 
 		 207 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0437067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309374  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24400  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608929  normal  0.879879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0856304  normal  0.963089 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R20  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0024  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.158579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0051  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000340535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0071  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0097  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000321345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0005  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0097  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000263693  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4199  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.81521e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0525  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000996192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>