More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1755 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0373  phosphoglucomutase  60.14 
 
 		 559 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.634415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  57.17 
 
 		 546 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  88.87 
 
 		 557 aa  1030    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  57.6 
 
 		 557 aa  634    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  61.33 
 
 		 561 aa  688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01520  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  61.44 
 
 		 556 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  61.55 
 
 		 556 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0258  phosphoglucomutase  59.78 
 
 		 551 aa  653    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1755  phosphoglucomutase  100 
 
 		 558 aa  1137    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  57.81 
 
 		 549 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  58.2 
 
 		 553 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  59.43 
 
 		 564 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.96 
 
 		 547 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.17 
 
 		 544 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  57.87 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  57.35 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  56.68 
 
 		 563 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  56.32 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  57.07 
 
 		 561 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  55.83 
 
 		 545 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  56.68 
 
 		 552 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  56.86 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  56.86 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  56.86 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.96 
 
 		 548 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  57.27 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  54.79 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  56.35 
 
 		 546 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  54.61 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  54.61 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  55.43 
 
 		 547 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  55.8 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  57.61 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  55.42 
 
 		 549 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  54.79 
 
 		 548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.15 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  55.58 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  52.42 
 
 		 550 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  55.42 
 
 		 551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  53.71 
 
 		 545 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  52.78 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  52.42 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5250  phosphoglucomutase  56.94 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254394  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  52.78 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  52.24 
 
 		 550 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  52.24 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  52.6 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  53.71 
 
 		 545 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  54.43 
 
 		 545 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  54.78 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  55.88 
 
 		 550 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  54.78 
 
 		 550 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  52.42 
 
 		 550 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  53.96 
 
 		 548 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  51.89 
 
 		 550 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  55.8 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  52.42 
 
 		 550 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  55.62 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1231  phosphoglucomutase  55.11 
 
 		 566 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  53.08 
 
 		 559 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  55.98 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  54.51 
 
 		 549 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  55.33 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  53.78 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  53.16 
 
 		 545 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  54.24 
 
 		 572 aa  585  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  53.26 
 
 		 548 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  57.06 
 
 		 550 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  53.28 
 
 		 550 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  53.14 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  54.79 
 
 		 547 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  54.17 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  53.97 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  53.97 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3003  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  57.71 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  54.61 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  51.81 
 
 		 550 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  54.43 
 
 		 547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  53.08 
 
 		 547 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  51.41 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  52.71 
 
 		 548 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  53.79 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  53.53 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  53.53 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  53.5 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  52.89 
 
 		 550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  51.8 
 
 		 547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  53.6 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  53.49 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  53.6 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  52.62 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  52.85 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  52.92 
 
 		 551 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  53.96 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  53.96 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  52.67 
 
 		 550 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  52.44 
 
 		 548 aa  571  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  53.78 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  53.96 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  53.96 
 
 		 546 aa  568  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>