34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0081 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  311  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  42.74 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1186  hypothetical protein  36.43 
 
 		 127 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222804  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  35.23 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  36.36 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  34.52 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  47.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  47.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  46.77 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5346  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 388 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 388 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  46.67 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4399  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.96 
 
 		 653 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  30.93 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.43 
 
 		 645 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  31.65 
 
 		 640 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  31.65 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  31.65 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  28.79 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  36.92 
 
 		 637 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.75 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  40 
 
 		 393 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.77 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.77 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 320 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 101 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>