38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2694 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2694  putative cytochrome c family protein  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.97531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1186  hypothetical protein  40.8 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222804  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0081  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.824718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2431  class I monoheme cytochrome c  37.78 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0928963  normal  0.0529755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0393  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789834  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0775  class I monoheme cytochrome c  37.04 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0404  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  30.97 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  29.55 
 
 		 642 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  43.9 
 
 		 388 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  34.07 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.11 
 
 		 615 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  28.72 
 
 		 254 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  37.25 
 
 		 535 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  29.36 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0749  hypothetical protein  36.59 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  44.74 
 
 		 394 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  45.65 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  42.11 
 
 		 394 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 393 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 394 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  42.11 
 
 		 394 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  26.5 
 
 		 640 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  26.72 
 
 		 640 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  35 
 
 		 683 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  27.93 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3426  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  54.55 
 
 		 298 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4942  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140936  unclonable  0.0000158871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  26.72 
 
 		 642 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  26.72 
 
 		 642 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  32.18 
 
 		 644 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 154 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.59 
 
 		 637 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>