More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2749 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2749  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  41.2 
 
 
295 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  46.22 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1140  ubiquinol oxidase, subunit II  40.65 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  41.9 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  41.34 
 
 
320 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  41.34 
 
 
340 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
296 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
300 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
330 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
296 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  42.69 
 
 
296 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
330 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  43.7 
 
 
300 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
296 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
282 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
282 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
295 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
282 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  42.69 
 
 
295 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47210  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  40.71 
 
 
331 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000853268  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  40.71 
 
 
326 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  42.29 
 
 
377 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  41.11 
 
 
295 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  42.29 
 
 
295 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  40.71 
 
 
283 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5108  ubiquinol oxidase, subunit II  41.29 
 
 
400 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  39.68 
 
 
335 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5824  ubiquinol oxidase, subunit II  41.7 
 
 
305 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0741  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  41.02 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.586473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  39.02 
 
 
306 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  39.76 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0656  ubiquinol oxidase, subunit II  41.02 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  40.32 
 
 
281 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  40.32 
 
 
295 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  40.32 
 
 
295 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  39.76 
 
 
341 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  38.98 
 
 
330 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  40.32 
 
 
297 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  39.53 
 
 
319 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2775  ubiquinol oxidase, subunit II  39.85 
 
 
349 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.608558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2917  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  42.91 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215988  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  38.01 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2265  ubiquinol oxidase, subunit II  39.46 
 
 
349 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1508  ubiquinol oxidase, subunit II  40.23 
 
 
409 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.205706  normal  0.237514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0948  ubiquinol oxidase, subunit II  41.3 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05491  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  40.38 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2107  ubiquinol oxidase, subunit II  40.71 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1977  ubiquinol oxidase, subunit II  40.71 
 
 
283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3241  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  41.63 
 
 
318 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.46443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3098  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  41.63 
 
 
318 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3060  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  41.63 
 
 
318 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000967712  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2223  ubiquinol oxidase, subunit II  39.85 
 
 
349 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.0191751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.3 
 
 
313 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3795  ubiquinol oxidase, subunit II  39.29 
 
 
301 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  40.07 
 
 
313 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  35.87 
 
 
313 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  40.07 
 
 
313 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1744  putative cytochrome o ubiquinol oxidase chain II protein  40.3 
 
 
343 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195887  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0294  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.96 
 
 
272 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  39.71 
 
 
313 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1043  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.86 
 
 
320 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0760278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0982  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  41.34 
 
 
323 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3269  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.86 
 
 
320 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  37.96 
 
 
315 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0267  ubiquinol oxidase, subunit II  41.43 
 
 
304 aa  206  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0165424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03912  Ubiquinol oxidase polypeptide II (Cytochrome o subunit 2) (Oxidase BO(3) subunit 2) (Cytochrome o ubiquinol oxidase subunit  41.52 
 
 
313 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  40.69 
 
 
302 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  37.96 
 
 
315 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.96 
 
 
315 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.23 
 
 
309 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0366  ubiquinol oxidase, subunit II  37.15 
 
 
316 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  36.86 
 
 
318 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.23 
 
 
318 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  36.86 
 
 
318 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  41.25 
 
 
317 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0545  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  36.86 
 
 
309 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00734942  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4854  ubiquinol oxidase, subunit II  41.47 
 
 
387 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  39.08 
 
 
345 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3073  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  40.08 
 
 
317 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7135  ubiquinol oxidase, subunit II  38.11 
 
 
371 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.959293  normal  0.391928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3536  ubiquinol oxidase, subunit II  38.25 
 
 
269 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0516  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.59 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162933  normal  0.952162 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6217  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.59 
 
 
370 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  41.43 
 
 
314 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5608  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  39.08 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  37.55 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001553  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  40 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0242  ubiquinol oxidase, subunit II  36.88 
 
 
385 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0899  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  35.77 
 
 
315 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000156741  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  37.55 
 
 
350 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1290  ubiquinol oxidase, subunit II  38.65 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4372  ubiquinol oxidase, subunit II  36.98 
 
 
392 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>