41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0039 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  62.2 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  61.59 
 
 		 164 aa  204  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  59.15 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  58.54 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  56.1 
 
 		 164 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  59.76 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  50.3 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  51.22 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  44.85 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  46.06 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  48.78 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  46.91 
 
 		 167 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  48.78 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  48.17 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44.85 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  42 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  46.06 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  37.74 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  39.26 
 
 		 134 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  34.9 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  38.26 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  32.52 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 143 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.63 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>