34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1368 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  64 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  58.94 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  43.05 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  38.16 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  39.87 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  36.3 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  35.1 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  36.42 
 
 		 185 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  34.87 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  35.33 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  37.33 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  37.09 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  36.42 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  34.64 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  30.2 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  34.44 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  30.67 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  30.67 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  30.67 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0533  UspA domain protein  30.26 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000725599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>