33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0532 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  303  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  71.52 
 
 		 151 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  70.86 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  61.59 
 
 		 151 aa  200  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  66.89 
 
 		 151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  67.16 
 
 		 134 aa  193  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  63.33 
 
 		 151 aa  189  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  47.68 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  43.33 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  41.61 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  41.33 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  42 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  40.94 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  40.94 
 
 		 163 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  40.27 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  39.33 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  41.06 
 
 		 168 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  43.33 
 
 		 185 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  39.47 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  39.86 
 
 		 173 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  42.25 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  38.67 
 
 		 164 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  37.58 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  40.79 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  24.32 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>