35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0025 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  100 
 
 		 163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  97.55 
 
 		 163 aa  294  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  85.89 
 
 		 163 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  87.12 
 
 		 163 aa  273  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  65.03 
 
 		 163 aa  224  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  61.96 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  63.8 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  62.35 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  53.99 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  55.56 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  48.17 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  47.56 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  46 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  46.91 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  46.95 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  44.51 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  45.12 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  45.68 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  38.06 
 
 		 134 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  36.84 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  39.47 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  39.33 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 		 295 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 		 295 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  40.48 
 
 		 295 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>