31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0458 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0458  UspA  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  89.02 
 
 		 164 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  89.57 
 
 		 164 aa  283  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  78.05 
 
 		 164 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  70.73 
 
 		 164 aa  242  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  241  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  56.1 
 
 		 164 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  49.39 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  48.17 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  46.01 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  45.4 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  45.4 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44.79 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  43.9 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  44.51 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  45.4 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  44.17 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  44.51 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  46.36 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  38.36 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  40.13 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  37.66 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  34.85 
 
 		 134 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>