42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3395 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  321  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  90.42 
 
 		 167 aa  285  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  55.28 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  49.69 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  49.38 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  46.91 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  45.06 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  49.39 
 
 		 179 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  45.06 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  46.91 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  45.4 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  45.4 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  44.79 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  44.17 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  45.4 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  45.06 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  44.17 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  47.53 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  39.87 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  39.22 
 
 		 185 aa  90.5  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  38.26 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  34.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.27 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  33.33 
 
 		 313 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.32 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.38 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.05 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  26.39 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>