34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4036 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  329  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  65.43 
 
 		 163 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  62.96 
 
 		 162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  65.03 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  63.8 
 
 		 163 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  61.96 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  62.96 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  62.96 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  51.53 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  52.76 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  48.17 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  54.9 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  48.17 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  49.69 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  47.56 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  44.85 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  47.06 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  48.47 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  42.41 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  40.46 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  32.45 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  27.15 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>