32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0297 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  330  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  54.94 
 
 		 163 aa  173  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  0.0000151739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  54.66 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  51.53 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  53.75 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  52.98 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  51.55 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  53.37 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  55.21 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  57.76 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  54.6 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  50.61 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  53.99 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  49.39 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  51.22 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  53.75 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  51.85 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  55.28 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  50.92 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  49.67 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  49.01 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  47.68 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  45.39 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  41.18 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  47.37 
 
 		 134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  41.83 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  45.39 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  33.99 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>