78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7104 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7104  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  62.96 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  58.14 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  58.21 
 
 		 330 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7685  transposase  58.21 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  40.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  40.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  40.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  40.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  45.59 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  40.28 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4297  hypothetical protein  40.28 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14768  normal  0.16498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  38.03 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 		 304 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  36.62 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  36.62 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  39.71 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  39.71 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 		 198 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  38.03 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  37.68 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  36.62 
 
 		 302 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  36.62 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  37.14 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  37.14 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  43.48 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  37.14 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  35 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  37.14 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  37.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  37.14 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  37.14 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  39.68 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  41.27 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  35.21 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  35.21 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  35.21 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  36.78 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  41.18 
 
 		 320 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  40.26 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  33.8 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  33.8 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  33.8 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  34.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4922  hypothetical protein  52.5 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  35.71 
 
 		 307 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4562  putative transposase  44.9 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.563601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3090  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.438523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>