75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7685 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7685  transposase  100 
 
 
69 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  76.47 
 
 
176 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  69.7 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  60.61 
 
 
330 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7104  hypothetical protein  58.21 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  42.19 
 
 
320 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  42.19 
 
 
305 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  38.81 
 
 
132 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  42.19 
 
 
305 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  41.38 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  41.54 
 
 
304 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
262 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  39.66 
 
 
307 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  36.23 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  36.76 
 
 
289 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  36.76 
 
 
282 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  36.92 
 
 
306 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  36.92 
 
 
306 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  36.92 
 
 
306 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  36.92 
 
 
306 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
307 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
307 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
307 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
307 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  41.82 
 
 
104 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  41.82 
 
 
104 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  41.82 
 
 
104 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  36.76 
 
 
302 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  36.92 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  34.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  35.29 
 
 
300 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40 
 
 
301 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  40.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
306 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4562  putative transposase  45.65 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.563601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  40.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  40.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  40.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4297  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14768  normal  0.16498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  32.84 
 
 
126 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  52.94 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3090  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.438523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4922  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>