35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4562 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4562  putative transposase  100 
 
 
68 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.563601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  75.38 
 
 
126 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0102  hypothetical protein  72.58 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2016  hypothetical protein  72.58 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0244839  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4849  hypothetical protein  72.58 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4890  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.815431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4869  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4439  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4413  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4297  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.14768  normal  0.16498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1697  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0652022  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3090  hypothetical protein  72.41 
 
 
73 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.438523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4922  hypothetical protein  72.41 
 
 
73 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.42 
 
 
356 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  41.79 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  39.19 
 
 
330 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  41.79 
 
 
319 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  38.24 
 
 
307 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 
307 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40.98 
 
 
301 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 
310 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 
319 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  56.52 
 
 
108 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  40.3 
 
 
304 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  40.3 
 
 
319 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  36.76 
 
 
305 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  35.29 
 
 
320 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  37.31 
 
 
305 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  47.83 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  36.76 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  40.74 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  46.77 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7685  transposase  45.65 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  32.35 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7104  hypothetical protein  44.9 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>