39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0969 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  57.72 
 
 
623 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  75.15 
 
 
647 aa  976    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  74.18 
 
 
641 aa  903    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  58.44 
 
 
658 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  55.14 
 
 
661 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  58.86 
 
 
655 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  57.71 
 
 
662 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  58.71 
 
 
649 aa  724    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  58.13 
 
 
658 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  58.72 
 
 
658 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  60.85 
 
 
653 aa  737    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  62.34 
 
 
645 aa  760    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  100 
 
 
648 aa  1305    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  54.95 
 
 
693 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  56.23 
 
 
650 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  56.88 
 
 
660 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  52.86 
 
 
705 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  50.17 
 
 
667 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  58.75 
 
 
736 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  61.19 
 
 
717 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  57.14 
 
 
717 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  26.02 
 
 
608 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  26.02 
 
 
608 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  27.43 
 
 
615 aa  54.7  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  25.57 
 
 
658 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  24.59 
 
 
654 aa  52  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  22.26 
 
 
585 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  23.8 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  21.51 
 
 
609 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  23.62 
 
 
629 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  24.83 
 
 
608 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  27.19 
 
 
608 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  25.46 
 
 
365 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  25.84 
 
 
608 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  27.57 
 
 
608 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  27.57 
 
 
608 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  27.57 
 
 
608 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  25.37 
 
 
677 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  21.24 
 
 
627 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>