23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1862 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  58.71 
 
 		 648 aa  693    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  60.1 
 
 		 623 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  62.36 
 
 		 655 aa  762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  59.44 
 
 		 653 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  59.48 
 
 		 658 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  57.61 
 
 		 647 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  58.29 
 
 		 641 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  100 
 
 		 649 aa  1298    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  60.15 
 
 		 658 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  54.87 
 
 		 693 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  63.07 
 
 		 658 aa  773    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  56.76 
 
 		 645 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  60.22 
 
 		 650 aa  719    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  58.26 
 
 		 662 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  55.11 
 
 		 661 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  55.18 
 
 		 660 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  54.59 
 
 		 705 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  46.12 
 
 		 667 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  52.94 
 
 		 736 aa  353  5e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  52.96 
 
 		 717 aa  332  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  56.17 
 
 		 717 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  25.23 
 
 		 682 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  25.67 
 
 		 654 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>