21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6406 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  59.37 
 
 
641 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  55.23 
 
 
693 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  100 
 
 
653 aa  1284    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  59.65 
 
 
623 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  60.84 
 
 
655 aa  755    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  60.62 
 
 
658 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  60.38 
 
 
647 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  59.44 
 
 
649 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  62.09 
 
 
658 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  59.63 
 
 
658 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  57.3 
 
 
645 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  57.59 
 
 
650 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  60.85 
 
 
648 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  58.97 
 
 
662 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  55.52 
 
 
705 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  54.84 
 
 
661 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  56.7 
 
 
660 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  47.75 
 
 
667 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  59.23 
 
 
717 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  54.71 
 
 
736 aa  347  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  51.41 
 
 
717 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>