23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1873 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  61.34 
 
 
662 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  63.94 
 
 
623 aa  767    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  64.63 
 
 
655 aa  828    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  80.4 
 
 
658 aa  1002    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  62.09 
 
 
653 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  61.31 
 
 
647 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  58.37 
 
 
641 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  60.15 
 
 
649 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  100 
 
 
658 aa  1315    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  71.28 
 
 
658 aa  934    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  54.87 
 
 
645 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  60.31 
 
 
650 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  58.13 
 
 
648 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  53.4 
 
 
693 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  51.37 
 
 
661 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  52.05 
 
 
660 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  50.38 
 
 
705 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  45.73 
 
 
667 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  56.68 
 
 
717 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  54.97 
 
 
736 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  54.12 
 
 
717 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  24.11 
 
 
658 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  23.52 
 
 
654 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>