27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0848 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  61.98 
 
 		 662 aa  700    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  64.19 
 
 		 655 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  63.46 
 
 		 623 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  59.84 
 
 		 653 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  69.76 
 
 		 658 aa  875    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  53.32 
 
 		 693 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  59.53 
 
 		 647 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  56.85 
 
 		 641 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  63.07 
 
 		 649 aa  790    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  71.28 
 
 		 658 aa  929    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  61.74 
 
 		 650 aa  785    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1318    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  58.72 
 
 		 648 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  55.92 
 
 		 645 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  54.59 
 
 		 661 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  54.29 
 
 		 705 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  54.36 
 
 		 660 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  45.89 
 
 		 667 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  55.06 
 
 		 736 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  54.3 
 
 		 717 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  52.23 
 
 		 717 aa  338  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  23.68 
 
 		 658 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  24.58 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  23.32 
 
 		 654 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  23.22 
 
 		 636 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  24.11 
 
 		 614 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  22.92 
 
 		 682 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>