28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4510 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0969  putative amino acid transporter  75.15 
 
 
648 aa  959    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1808  putative amino acid transporter  54.72 
 
 
705 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1789  hypothetical protein  60.16 
 
 
658 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3233  putative amino acid transporter  55.59 
 
 
661 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.643169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4510  putative amino acid transporter  100 
 
 
647 aa  1305    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5173  hypothetical protein  59.69 
 
 
655 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2094  hypothetical protein  58.75 
 
 
623 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1599  putative amino acid transporter  73.63 
 
 
641 aa  894    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  60.38 
 
 
653 aa  725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4935  hypothetical protein  56.28 
 
 
662 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00817564  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1862  amino acid transporter  57.61 
 
 
649 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1873  hypothetical protein  61.31 
 
 
658 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1109  hypothetical protein  55.17 
 
 
693 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0848  hypothetical protein  59.53 
 
 
658 aa  755    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0609  putative amino acid transporter  60.86 
 
 
645 aa  730    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  56.94 
 
 
650 aa  684    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0519  putative amino acid transporter  55.66 
 
 
660 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3939  hypothetical protein  46.44 
 
 
667 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2825  hypothetical protein  62.72 
 
 
717 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.195289  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0279  hypothetical protein  59.12 
 
 
736 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1035  hypothetical protein  56.21 
 
 
717 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.46088  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  27.1 
 
 
658 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  28.65 
 
 
608 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  28.65 
 
 
608 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  28.21 
 
 
654 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  27.89 
 
 
608 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  25.91 
 
 
608 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  25.91 
 
 
365 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>