224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0853 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0853  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 78 aa  146  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  46.67 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  40 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0048  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.858481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  38.24 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  43.08 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 77 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 77 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  33.8 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  37.88 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  40 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  40.28 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  38.57 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0397  phosphopantetheine-binding  37.33 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  42.65 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26769  predicted protein  41.1 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.973037  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  38.24 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  35.82 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  44.12 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  36.36 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  39.44 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2446  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00306712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  34.21 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>