47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2696 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2696  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  0.0590164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2888  hypothetical protein  50.17 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2795  hypothetical protein  50.51 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2702  hypothetical protein  51.41 
 
 
285 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  26.26 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  26.26 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  26.26 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  33.68 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  30.61 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.52 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31 
 
 
239 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  22.35 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  31.91 
 
 
487 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  31.58 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  22.44 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  26.26 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  23.23 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  26.26 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 
262 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 
262 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 
262 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 
262 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  26.26 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  22.22 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  26.6 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.47 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  26.6 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 
258 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  26.6 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  25.74 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>