43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2888 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2795  hypothetical protein  99.3 
 
 		 285 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2702  hypothetical protein  93.68 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2696  hypothetical protein  52.55 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  0.0590164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  37.76 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  32.35 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  32.35 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  31.37 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  33.67 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  34.69 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  31.37 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.46 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  34.69 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  34 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.91 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.98 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  22.92 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  26.32 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.03 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  27.18 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  28.07 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  22.92 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  33.72 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  21.88 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  32.41 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  31.1 
 
 		 619 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  25.77 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>