More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2688 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  70.64 
 
 		 545 aa  751    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 529 aa  1048    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  32.7 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  32.19 
 
 		 534 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  32.26 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  29.25 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.23 
 
 		 5469 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.39 
 
 		 1317 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.43 
 
 		 5926 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  32.82 
 
 		 1321 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  29.01 
 
 		 1194 aa  203  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.1 
 
 		 13537 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  30.06 
 
 		 983 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  27.63 
 
 		 1193 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0415  amino acid adenylation domain-containing protein  26.97 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.89 
 
 		 1839 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.27 
 
 		 2385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 		 1158 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 		 3208 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 		 6176 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.95 
 
 		 3432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.44 
 
 		 2386 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  33.13 
 
 		 2187 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.91 
 
 		 2573 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1311  conserved hypothetical protein, putative amino acid adenylation domain protein  28.77 
 
 		 498 aa  196  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000252805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1466  amino acid adenylation domain-containing protein  26.25 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  27.22 
 
 		 1193 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.4 
 
 		 4383 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  33.74 
 
 		 5467 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  34.22 
 
 		 1436 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.08 
 
 		 8646 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  30.49 
 
 		 602 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.28 
 
 		 2385 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 2571 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  31.72 
 
 		 2606 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.2 
 
 		 1714 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 		 5328 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 2571 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  29.67 
 
 		 625 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  29.8 
 
 		 923 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  29.58 
 
 		 1518 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.92 
 
 		 2385 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  30.39 
 
 		 3194 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  30.11 
 
 		 3942 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  27.85 
 
 		 1518 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  34.23 
 
 		 1130 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  31.98 
 
 		 1449 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  30.7 
 
 		 2855 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 		 3639 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 		 4968 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 		 2258 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  31.59 
 
 		 522 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.63 
 
 		 2581 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  29.51 
 
 		 923 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 		 2845 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  32.18 
 
 		 5372 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  29.57 
 
 		 565 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1496  amino acid adenylation domain-containing protein  27.36 
 
 		 502 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  32 
 
 		 1290 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.27 
 
 		 2867 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1322  amino acid adenylation domain-containing protein  25.87 
 
 		 503 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.47 
 
 		 5929 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.25 
 
 		 2385 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.71 
 
 		 2385 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.06 
 
 		 3021 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.18 
 
 		 2385 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.25 
 
 		 2385 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 		 3331 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  29.47 
 
 		 1145 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  28.41 
 
 		 1550 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 		 3235 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.38 
 
 		 2385 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.45 
 
 		 6676 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 		 7712 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.19 
 
 		 1753 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.74 
 
 		 1336 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  35.19 
 
 		 2315 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.03 
 
 		 2370 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  29.2 
 
 		 1518 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.01 
 
 		 4882 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.39 
 
 		 2151 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.95 
 
 		 1769 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  29.71 
 
 		 1142 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.59 
 
 		 3002 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 		 6202 aa  187  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.9 
 
 		 9175 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.75 
 
 		 9498 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.87 
 
 		 8914 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.11 
 
 		 3650 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.27 
 
 		 7310 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  30.27 
 
 		 2033 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  33.98 
 
 		 2189 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.08 
 
 		 2154 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  29.45 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.69 
 
 		 2385 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 1137 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  31.2 
 
 		 5230 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  31.59 
 
 		 1334 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>