38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0004 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t02  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0460294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0058  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000131227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0049  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0054  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0054  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0056  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000109894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0021  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0010  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.172147  normal  0.574925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.656534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0027  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0034  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07685  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0008  tRNA-Thr  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.443897  hitchhiker  0.0012739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0045  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.760301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0017  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000513914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0016  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0057  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.117051  hitchhiker  0.00489854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0011  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>