26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0034 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06720  tRNA-Ala  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0037  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0040  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0034  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000924303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1917  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0035  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0186  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0004  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0079    96.3 
 
 		 282 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0062  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0011    96.3 
 
 		 226 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t40  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0209  tRNA-His  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.524642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>