22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_R0079 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_R0079    100 
 
 		 282 bp  559  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0011    98.46 
 
 		 226 bp  121  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_CjtmRNA1  sRNA  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0049  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00140  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0038  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.559626  normal  0.321441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0290  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0051  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0870511  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1752  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0060  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0054  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0034  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0010  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0053    93.55 
 
 		 387 bp  46.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>