14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1752 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_CjtmRNA1  sRNA  100 
 
 		 359 bp  712    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1752  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 359 bp  712    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0290  10Sa RNA (tmRNA)  99.44 
 
 		 359 bp  696    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1272  10Sa RNA (tmRNA)  91.84 
 
 		 361 bp  238  9e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.423231  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2196    91.89 
 
 		 359 bp  174  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.310411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2269  putative tmRNA  91.22 
 
 		 359 bp  167  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0467  10Sa RNA (tmRNA)  96.94 
 
 		 361 bp  163  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1796  putative tmRNA  88.64 
 
 		 361 bp  87.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1273  tmRNA proteolysis tag  97.78 
 
 		 45 bp  81.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.386573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0079    93.75 
 
 		 282 bp  48.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_s1521    93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0021567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0053    93.75 
 
 		 387 bp  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0011    93.75 
 
 		 226 bp  48.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0338  10Sa RNA (tmRNA)  100 
 
 		 328 bp  46.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>