14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0053 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0053    100 
 
 		 387 bp  767    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234265  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_s1521    100 
 
 		 359 bp  58  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0021567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0017    91.89 
 
 		 366 bp  50.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000532181  normal  0.0602003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_CjtmRNA1  sRNA  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0018  tmRNA, 10Sa RNA  93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000501526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3016  10Sa RNA (tmRNA)  91.67 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1752  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0290  10Sa RNA (tmRNA)  93.75 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0035  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0079    93.55 
 
 		 282 bp  46.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0045    91.43 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00142685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0011    93.55 
 
 		 226 bp  46.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>