79 genes were found for organism Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tmz1t_2335  CDS  NC_011667  23  301  279  hypothetical protein  YP_002364166  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2336  CDS  NC_011667  298  627  330  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_002364167  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2337  CDS  NC_011667  597  1022  426  hypothetical protein  YP_002364168  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2338  CDS  NC_011667  1188  1436  249  helix-turn-helix domain protein  YP_002364169  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2339  CDS  NC_011667  2478  3515  1038  hypothetical protein  YP_002364170  normal  0.895594  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2340  CDS  NC_011667  3912  4400  489  nuclease (SNase domain protein)  YP_002364171  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2341  CDS  NC_011667  4405  4659  255  hypothetical protein  YP_002364172  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2342  CDS  NC_011667  4691  5296  606  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_002364173  normal  0.944243  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2343  CDS  NC_011667  5289  6245  957  hypothetical protein  YP_002364174  normal  0.671836  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2344  CDS  NC_011667  6426  7106  681  protein of unknown function DUF159  YP_002364175  normal  0.670421  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2345  CDS  NC_011667  7246  10212  2967  transposase Tn3 family protein  YP_002364176  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2346    NC_011667  10265  10446  182      normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2347  CDS  NC_011667  10508  11122  615  Resolvase domain protein  YP_002364177  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2348  CDS  NC_011667  11522  12298  777  hypothetical protein  YP_002364178  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2349  CDS  NC_011667  13377  14186  810  hypothetical protein  YP_002364179  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2350  CDS  NC_011667  14299  15252  954  Sel1 domain protein repeat-containing protein  YP_002364180  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2351  CDS  NC_011667  15417  15686  270  hypothetical protein  YP_002364181  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2352  CDS  NC_011667  15704  17026  1323  transposase ISL3 family protein  YP_002364182  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2353  CDS  NC_011667  18148  18498  351  DNA polymerase beta domain protein region  YP_002364183  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2354  CDS  NC_011667  18863  19900  1038  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  YP_002364184  normal  normal  0.309704  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2355    NC_011667  20098  20193  96      normal  0.659599  normal  0.0992256  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2356  CDS  NC_011667  20799  21878  1080  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_002364185  normal  0.337618  normal  0.0354802  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2357  CDS  NC_011667  21898  22428  531  hypothetical protein  YP_002364186  normal  0.25703  normal  0.0206538  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2358  CDS  NC_011667  22504  23115  612  hypothetical protein  YP_002364187  normal  0.427647  hitchhiker  0.00122895  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2359  CDS  NC_011667  23287  23625  339  hypothetical protein  YP_002364188  normal  0.919622  hitchhiker  0.000210039  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2360  CDS  NC_011667  23714  24382  669  protein of unknown function DUF159  YP_002364189  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2361  CDS  NC_011667  24626  25540  915  hypothetical protein  YP_002364190  normal  0.206277  hitchhiker  0.0000361585  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2362  CDS  NC_011667  25533  26138  606  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_002364191  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2363  CDS  NC_011667  26169  26429  261  hypothetical protein  YP_002364192  hitchhiker  0.000851565  hitchhiker  0.0000226429  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2364  CDS  NC_011667  26437  26952  516  nuclease (SNase domain protein)  YP_002364193  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2365  CDS  NC_011667  27294  27818  525  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_002364194  hitchhiker  0.0000368408  hitchhiker  0.000000322057  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2366  CDS  NC_011667  27815  28552  738  hypothetical protein  YP_002364195  hitchhiker  0.000000325421  hitchhiker  0.00000017769  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2367  CDS  NC_011667  28549  29238  690  hypothetical protein  YP_002364196  hitchhiker  0.00000000358254  hitchhiker  0.0000000046213  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2368  CDS  NC_011667  32004  32675  672  Resolvase domain protein  YP_002364197  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2369  CDS  NC_011667  32822  33052  231  hypothetical protein  YP_002364198  hitchhiker  0.000894038  hitchhiker  0.0000000353717  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2370  CDS  NC_011667  33049  33639  591  hypothetical protein  YP_002364199  normal  0.013446  hitchhiker  0.000000048655  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2371  CDS  NC_011667  33755  35014  1260  DNA-cytosine methyltransferase  YP_002364200  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2372  CDS  NC_011667  35047  35460  414  DNA mismatch endonuclease Vsr  YP_002364201  normal  hitchhiker  0.00000182127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2373  CDS  NC_011667  35503  36504  1002  restriction endonuclease-like protein  YP_002364202  normal  hitchhiker  0.0000067766  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2374  CDS  NC_011667  36652  37293  642  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002364203  normal  hitchhiker  0.0000187977  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2375  CDS  NC_011667  37356  37643  288  CopG domain protein DNA-binding domain protein  YP_002364204  normal  hitchhiker  0.0000499063  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2376  CDS  NC_011667  37667  38719  1053  plasmid encoded RepA protein  YP_002364205  normal  hitchhiker  0.00013928  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2377    NC_011667  38641  39051  411      normal  hitchhiker  0.0000802244  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2378  CDS  NC_011667  39162  40250  1089  cointegrate resolution protein T  YP_002364206  normal  hitchhiker  0.0000723193  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2379  CDS  NC_011667  40518  41075  558  Ankyrin  YP_002364207  normal  hitchhiker  0.000440604  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2380  CDS  NC_011667  41160  41537  378  hypothetical protein  YP_002364208  normal  0.965893  hitchhiker  0.0005872  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2381  CDS  NC_011667  41603  41989  387  hypothetical protein  YP_002364209  normal  0.744293  hitchhiker  0.000221897  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2382  CDS  NC_011667  42031  45150  3120  heavy metal efflux pump, CzcA family  YP_002364210  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2383  CDS  NC_011667  45166  46278  1113  hypothetical protein  YP_002364211  hitchhiker  0.0037846  normal  0.0270218  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2384  CDS  NC_011667  46275  46838  564  hypothetical protein  YP_002364212  hitchhiker  0.00181939  normal  0.0396666  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2385  CDS  NC_011667  46856  48121  1266  outer membrane efflux protein  YP_002364213  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2386  CDS  NC_011667  48255  48602  348  hypothetical protein  YP_002364214  hitchhiker  0.000211646  normal  0.0960763  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2387  CDS  NC_011667  48731  49069  339  hypothetical protein  YP_002364215  hitchhiker  0.00036703  normal  0.166527  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2388  CDS  NC_011667  49238  49924  687  heavy metal response regulator  YP_002364216  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2389  CDS  NC_011667  49927  51264  1338  heavy metal sensor kinase  YP_002364217  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2390  CDS  NC_011667  51283  53685  2403  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002364218  normal  0.0451824  normal  0.128679  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2391  CDS  NC_011667  53796  54251  456  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  YP_002364219  normal  0.0284263  normal  0.3053  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2392  CDS  NC_011667  54306  55247  942  integrase family protein  YP_002364220  normal  0.0530338  normal  0.472164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2393  CDS  NC_011667  55235  55591  357  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  YP_002364221  normal  0.0840509  normal  0.984968  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2394  CDS  NC_011667  55594  58617  3024  transposase Tn3 family protein  YP_002364222  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2395  CDS  NC_011667  58708  58857  150  hypothetical protein  YP_002364223  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2396  CDS  NC_011667  59042  59356  315  hypothetical protein  YP_002364224  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2397  CDS  NC_011667  59390  59920  531  hypothetical protein  YP_002364225  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2398    NC_011667  59940  61020  1081      normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2399  CDS  NC_011667  61742  62686  945  hypothetical protein  YP_002364226  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2400  CDS  NC_011667  62726  63007  282  CopG domain protein DNA-binding domain protein  YP_002364227  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2401  CDS  NC_011667  63071  63712  642  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002364228  normal  0.266448  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2402  CDS  NC_011667  63812  65776  1965  protein of unknown function DUF524  YP_002364229  normal  0.63975  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2403  CDS  NC_011667  65778  67793  2016  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  YP_002364230  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2404  CDS  NC_011667  67834  68751  918  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_002364231  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2405  CDS  NC_011667  68886  69107  222  hypothetical protein  YP_002364232  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2406  CDS  NC_011667  69461  69829  369  hypothetical protein  YP_002364233  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2407  CDS  NC_011667  70762  71559  798  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_002364234  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2408  CDS  NC_011667  71552  73042  1491  Integrase catalytic region  YP_002364235  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2409  CDS  NC_011667  73527  74252  726  hypothetical protein  YP_002364236  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2410  CDS  NC_011667  74321  74989  669  hypothetical protein  YP_002364237  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2411  CDS  NC_011667  75253  76200  948  HNH endonuclease  YP_002364238  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2412  CDS  NC_011667  76600  77427  828  hypothetical protein  YP_002364239  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Tmz1t_2413  CDS  NC_011667  77790  78338  549  integrase family protein  YP_002364240  normal  normal  Thauera sp. MZ1T  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>