11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2365 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2365  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000368408  hitchhiker  0.000000322057 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0010  hypothetical protein  48.84 
 
 
172 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08255  hypothetical protein  46.82 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4895  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.79 
 
 
345 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3763  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.59 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000367548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4627  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.17 
 
 
347 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  37.82 
 
 
252 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2560  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.38 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00663072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  32.35 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>