285 genes were found for organism Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
TK90_2604  CDS  NC_013930  57  473  +  417  hypothetical protein  YP_003494560  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2605  CDS  NC_013930  664  1422  +  759  single-strand binding protein  YP_003494561  normal  1  normal  0.678699  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2606  CDS  NC_013930  1512  1982  +  471  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_003494562  normal  1  normal  0.130389  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2607    NC_013930  2130  4537  +  2408      normal  1  normal  0.0617811  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2608    NC_013930  4611  5333  +  723      normal  0.362005  normal  0.126147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2609  CDS  NC_013930  5595  5837  +  243  hypothetical protein  YP_003494563  normal  0.0590429  normal  0.52418  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2610  CDS  NC_013930  5876  6139  +  264  hypothetical protein  YP_003494564  normal  0.0407027  normal  0.418898  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2611  CDS  NC_013930  6132  6704  +  573  metal dependent phosphohydrolase  YP_003494565  hitchhiker  0.00847931  normal  0.339126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2612  CDS  NC_013930  6756  7145  +  390  hypothetical protein  YP_003494566  hitchhiker  0.00941181  normal  0.404547  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2613  CDS  NC_013930  7188  7583  +  396  hypothetical protein  YP_003494567  normal  0.0596427  normal  0.767327  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2614  CDS  NC_013930  7630  7845  +  216  hypothetical protein  YP_003494568  normal  0.077269  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2615  CDS  NC_013930  7922  8053  +  132  hypothetical protein  YP_003494569  normal  0.0397058  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2616  CDS  NC_013930  8178  8615  +  438  WD40 repeat, subgroup  YP_003494570  normal  0.173979  normal  0.948356  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2617  CDS  NC_013930  8769  9035  +  267  hypothetical protein  YP_003494571  normal  0.200318  normal  0.699375  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2618  CDS  NC_013930  9133  9423  +  291  hypothetical protein  YP_003494572  normal  0.84216  normal  0.87665  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2619  CDS  NC_013930  9416  9703  +  288  hypothetical protein  YP_003494573  normal  0.558748  normal  0.762868  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2620  CDS  NC_013930  9920  10384  +  465  hypothetical protein  YP_003494574  normal  1  normal  0.595167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2621  CDS  NC_013930  10381  10914  +  534  hypothetical protein  YP_003494575  normal  0.945617  normal  0.434908  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2622  CDS  NC_013930  11166  11405  +  240  hypothetical protein  YP_003494576  normal  1  normal  0.405811  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2623  CDS  NC_013930  11419  11685  +  267  hypothetical protein  YP_003494577  normal  1  normal  0.346509  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2624  CDS  NC_013930  11700  11879  +  180  hypothetical protein  YP_003494578  normal  1  normal  0.305399  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2625  CDS  NC_013930  11876  12070  +  195  hypothetical protein  YP_003494579  normal  1  normal  0.280737  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2626  CDS  NC_013930  12124  12486  +  363  hypothetical protein  YP_003494580  normal  1  normal  0.574118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2627  CDS  NC_013930  12634  13113  +  480  hypothetical protein  YP_003494581  normal  1  normal  0.648894  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2628  CDS  NC_013930  13213  13602  +  390  hypothetical protein  YP_003494582  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2629  CDS  NC_013930  13673  13993  +  321  hypothetical protein  YP_003494583  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2630  CDS  NC_013930  14136  14516  +  381  hypothetical protein  YP_003494584  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2631  CDS  NC_013930  14666  15037  +  372  hypothetical protein  YP_003494585  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2632  CDS  NC_013930  15104  15445  +  342  hypothetical protein  YP_003494586  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2633  CDS  NC_013930  15451  16107  +  657  hypothetical protein  YP_003494587  normal  0.822827  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2634  CDS  NC_013930  16356  16682  +  327  DNA helicase II  YP_003494588  normal  0.241715  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2635  CDS  NC_013930  17025  17351  +  327  hypothetical protein  YP_003494589  normal  0.35133  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2636  CDS  NC_013930  17466  18269  +  804  hypothetical protein  YP_003494590  normal  0.539147  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2637  CDS  NC_013930  18408  18836  +  429  hypothetical protein  YP_003494591  normal  0.531774  normal  0.715666  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2638  CDS  NC_013930  18829  19116  +  288  hypothetical protein  YP_003494592  normal  0.321367  normal  0.791715  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2639  CDS  NC_013930  19363  19719  +  357  hypothetical protein  YP_003494593  normal  0.644764  normal  0.641859  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2640  CDS  NC_013930  20054  20269  +  216  hypothetical protein  YP_003494594  normal  0.395314  normal  0.659826  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2641  CDS  NC_013930  20269  20718  +  450  hypothetical protein  YP_003494595  normal  0.366831  normal  0.614275  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2642  CDS  NC_013930  20930  21103  +  174  hypothetical protein  YP_003494596  normal  0.554217  normal  0.465562  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2643  CDS  NC_013930  21103  21414  +  312  hypothetical protein  YP_003494597  normal  0.889769  normal  0.426203  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2644  CDS  NC_013930  21407  21643  +  237  hypothetical protein  YP_003494598  normal  0.806736  normal  0.514017  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2645  CDS  NC_013930  21655  21954  +  300  hypothetical protein  YP_003494599  normal  0.601067  normal  0.46287  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2646  CDS  NC_013930  22379  23206  +  828  lipoprotein  YP_003494600  normal  1  normal  0.46452  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2647  CDS  NC_013930  23294  24451  +  1158  metal dependent phosphohydrolase  YP_003494601  normal  1  normal  0.427362  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2648  CDS  NC_013930  24584  28480  +  3897  hypothetical protein  YP_003494602  normal  1  normal  0.472601  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2649  CDS  NC_013930  28578  28904  +  327  hypothetical protein  YP_003494603  normal  1  normal  0.417089  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2650  CDS  NC_013930  29241  29477  +  237  ATP/GTP-binding protein  YP_003494604  normal  1  normal  0.421015  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2651  CDS  NC_013930  29533  29853  +  321  hypothetical protein  YP_003494605  normal  1  normal  0.379397  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2652  CDS  NC_013930  29972  30163  +  192  hypothetical protein  YP_003494606  normal  1  normal  0.539051  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2653  CDS  NC_013930  30280  30516  +  237  putative recombinase  YP_003494607  normal  1  normal  0.498626  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2654  CDS  NC_013930  30513  30776  +  264  hypothetical protein  YP_003494608  normal  1  normal  0.456182  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2655  CDS  NC_013930  30824  31753  -  930  hypothetical protein  YP_003494609  normal  1  normal  0.416808  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2656  CDS  NC_013930  31970  32233  +  264  hypothetical protein  YP_003494610  normal  1  normal  0.482309  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2657  CDS  NC_013930  32244  32675  +  432  hypothetical protein  YP_003494611  normal  1  normal  0.455789  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2658  CDS  NC_013930  32802  34013  -  1212  hypothetical protein  YP_003494612  normal  1  normal  0.500683  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2659  CDS  NC_013930  34192  34545  +  354  hypothetical protein  YP_003494613  normal  0.42059  normal  0.424854  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2660  CDS  NC_013930  34542  35159  +  618  Uracil-DNA glycosylase superfamily  YP_003494614  normal  0.405963  normal  0.388577  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2661  CDS  NC_013930  35249  35662  +  414  hypothetical protein  YP_003494615  normal  0.943816  normal  0.302262  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2662  CDS  NC_013930  35741  36334  +  594  hypothetical protein  YP_003494616  normal  0.616095  normal  0.334581  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2663  CDS  NC_013930  36362  36823  +  462  hypothetical protein  YP_003494617  normal  0.23992  normal  0.281456  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2664  CDS  NC_013930  36814  37077  +  264  hypothetical protein  YP_003494618  normal  0.419312  normal  0.319068  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2665  CDS  NC_013930  37074  38159  +  1086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_003494619  normal  0.197642  normal  0.42008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2666  CDS  NC_013930  38182  38487  -  306  hypothetical protein  YP_003494620  normal  0.0618572  normal  0.509746  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2667  CDS  NC_013930  38574  38807  -  234  hypothetical protein  YP_003494621  normal  0.0348936  normal  0.47807  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2668  CDS  NC_013930  38955  39350  +  396  hypothetical protein  YP_003494622  normal  0.0390334  normal  0.463679  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2669  CDS  NC_013930  39817  40086  +  270  hypothetical protein  YP_003494623  normal  0.0299357  normal  0.513637  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2670  CDS  NC_013930  40186  40419  +  234  hypothetical protein  YP_003494624  normal  0.207071  normal  0.499549  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2671  CDS  NC_013930  40483  40944  +  462  hypothetical protein  YP_003494625  normal  0.174718  normal  0.708597  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2672  CDS  NC_013930  41219  41596  +  378  hypothetical protein  YP_003494626  normal  0.66888  normal  0.813872  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2673  CDS  NC_013930  41684  41893  +  210  hypothetical protein  YP_003494627  normal  0.426101  normal  0.750283  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2674  CDS  NC_013930  41977  42558  +  582  hypothetical protein  YP_003494628  normal  0.589564  normal  0.798448  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2675  CDS  NC_013930  42658  43311  +  654  hypothetical protein  YP_003494629  normal  0.229682  normal  0.640107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2676  CDS  NC_013930  43550  44179  +  630  hypothetical protein  YP_003494630  normal  0.935263  normal  0.313698  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2677  CDS  NC_013930  44228  44899  +  672  hypothetical protein  YP_003494631  normal  0.960016  normal  0.33049  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2678  CDS  NC_013930  45130  46497  +  1368  hypothetical protein  YP_003494632  normal  1  normal  0.228941  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2679  CDS  NC_013930  46573  46896  +  324  hypothetical protein  YP_003494633  normal  1  normal  0.19337  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2680  CDS  NC_013930  46907  47107  +  201  hypothetical protein  YP_003494634  normal  1  normal  0.180517  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2681  CDS  NC_013930  47310  47747  +  438  hypothetical protein  YP_003494635  normal  1  normal  0.271047  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2682  CDS  NC_013930  47846  48379  +  534  hypothetical protein  YP_003494636  normal  1  normal  0.296156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2683  CDS  NC_013930  48514  49086  +  573  hypothetical protein  YP_003494637  normal  0.824998  normal  0.319701  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2684  CDS  NC_013930  49183  49644  +  462  hypothetical protein  YP_003494638  normal  0.376974  normal  0.23879  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2685  CDS  NC_013930  49718  50035  +  318  hypothetical protein  YP_003494639  normal  0.217381  normal  0.175321  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2686    NC_013930  50099  51499  -  1401      normal  0.0836212  normal  0.413884  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2687  CDS  NC_013930  51614  53992  -  2379  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_003494640  normal  0.0299536  normal  0.27507  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2688  CDS  NC_013930  54129  54473  -  345  hypothetical protein  YP_003494641  normal  0.0163362  normal  0.234363  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2689  CDS  NC_013930  54589  55710  -  1122  transposase, IS605 OrfB family  YP_003494642  normal  0.104678  normal  0.242406  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2690  CDS  NC_013930  55742  55984  -  243  hypothetical protein  YP_003494643  normal  0.0341875  normal  0.174875  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2691  CDS  NC_013930  56010  56312  -  303  hypothetical protein  YP_003494644  normal  0.122252  normal  0.132658  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2692  CDS  NC_013930  57181  57411  +  231  hypothetical protein  YP_003494645  normal  0.20326  normal  0.173104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2693  CDS  NC_013930  57443  57754  +  312  hypothetical protein  YP_003494646  normal  0.224075  normal  0.181882  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2694  CDS  NC_013930  57787  58212  -  426  hypothetical protein  YP_003494647  normal  0.355152  normal  0.15263  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2695  CDS  NC_013930  58214  60172  -  1959  DNA ligase (NAD(+))  YP_003494648  normal  0.278401  normal  0.204857  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2696  CDS  NC_013930  60229  60438  -  210  hypothetical protein  YP_003494649  normal  0.267148  normal  0.191445  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2697  CDS  NC_013930  60441  60716  -  276  peptide synthase  YP_003494650  normal  0.271903  normal  0.198854  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2698  CDS  NC_013930  60900  61058  -  159  hypothetical protein  YP_003494651  normal  0.0968738  normal  0.148478  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2699  CDS  NC_013930  61135  63435  -  2301  Rad3-related DNA helicase-like protein  YP_003494652  normal  0.59552  normal  0.502063  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2700  CDS  NC_013930  63526  64227  +  702  hypothetical protein  YP_003494653  normal  0.964719  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2701  CDS  NC_013930  64224  64982  +  759  hypothetical protein  YP_003494654  normal  1  normal  1  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2702  CDS  NC_013930  65007  66056  +  1050  CRISPR-associated protein, Csf2 family  YP_003494655  normal  1  normal  0.930655  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
TK90_2703  CDS  NC_013930  66056  66712  +  657  hypothetical protein  YP_003494656  normal  1  normal  0.809879  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>