61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2686 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2686    100 
 
 		 1401 bp  2777    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.413884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0413  PhoH family protein  84.16 
 
 		 1419 bp  161  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.205876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0663  PhoH family protein  83.56 
 
 		 1410 bp  149  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.860719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1508  PhoH family protein  81.63 
 
 		 1401 bp  129  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00130  PhoH family protein  81.65 
 
 		 1398 bp  115  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.06025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0824  PhoH-like protein  82.35 
 
 		 1425 bp  111  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5223  PhoH family protein  81.86 
 
 		 1818 bp  111  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2200  PhoH family protein  80.4 
 
 		 1335 bp  85.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.033076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1234  PhoH family protein  85.15 
 
 		 1485 bp  81.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2582  PhoH family protein  84.26 
 
 		 1479 bp  79.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1554  PhoH-like protein  88.16 
 
 		 1410 bp  79.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000065778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0987  PhoH family protein  90.32 
 
 		 1728 bp  75.8  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0342  hypothetical protein  82.4 
 
 		 1353 bp  73.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1728  nucleotide binding protein  89.23 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0561726  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1537  PhoH-like ATPase  86.84 
 
 		 1689 bp  71.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1210  PhoH-like protein  86.08 
 
 		 1422 bp  69.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1469  PhoH family protein  83.33 
 
 		 1410 bp  67.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1185  PhoH family protein  83.33 
 
 		 1410 bp  67.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.940531 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1900    85.37 
 
 		 1403 bp  67.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2407  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1887 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0010  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1635 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2243  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1794 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2282  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1635 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1159  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1635 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.613186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1191  PhoH family protein  90.57 
 
 		 1728 bp  65.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171726  normal  0.0177982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1316  hypothetical protein  87.69 
 
 		 1719 bp  65.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1997  PhoH-like protein  87.69 
 
 		 1704 bp  65.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2563  PhoH family protein  85.19 
 
 		 1764 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1252  PhoH family protein  90.57 
 
 		 1728 bp  65.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00804597  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1396  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1794 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2187  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1896 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1886  PhoH family protein  87.69 
 
 		 1635 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3210  PhoH family protein  85.19 
 
 		 1764 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2186  PhoH-like protein  82.57 
 
 		 1689 bp  65.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.985404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1827  PhoH family protein  82.69 
 
 		 1788 bp  63.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0920  PhoH family protein  88.14 
 
 		 1821 bp  61.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.244887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1908  PhoH-like protein  88.14 
 
 		 1818 bp  61.9  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1889  PhoH family protein  100 
 
 		 1803 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.835175  hitchhiker  0.000000118582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1865  PhoH family protein  100 
 
 		 1803 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1803  PhoH family protein  100 
 
 		 1821 bp  60  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1795  PhoH family protein  85.14 
 
 		 1851 bp  60  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0220004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1775  PhoH family protein  100 
 
 		 1821 bp  60  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6214  PhoH-like protein  100 
 
 		 1803 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2029  PhoH family protein  100 
 
 		 1722 bp  60  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.877213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1222  PhoH-like protein  85.71 
 
 		 1428 bp  60  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0641  PhoH family protein  83.72 
 
 		 1431 bp  60  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0328663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5166  PhoH-like protein  100 
 
 		 1803 bp  60  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1946  PhoH-like protein  84.42 
 
 		 1452 bp  58  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1408  PhoH family protein  86.15 
 
 		 1806 bp  58  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.545496  normal  0.312062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2235  PhoH family protein  100 
 
 		 1686 bp  58  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0299193  hitchhiker  0.000000485186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2309  PhoH-like protein  96.88 
 
 		 1398 bp  56  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2290  PhoH family protein  85.07 
 
 		 1323 bp  54  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0434    88.24 
 
 		 1634 bp  54  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.546046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0428  PhoH family protein  86.44 
 
 		 1647 bp  54  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0593193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2341  PhoH family protein  90.48 
 
 		 1386 bp  52  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1970  PhoH-like protein  86.21 
 
 		 1695 bp  52  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.368565  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  92.11 
 
 		 864 bp  52  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1110  PhoH-like protein  90.48 
 
 		 1569 bp  52  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2392  putative ATPase, PhoH-like protein  84.62 
 
 		 1695 bp  50.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0563545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3789  PhoH family protein  88.89 
 
 		 1395 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 1224 bp  48.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>