60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2605 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2885  single-strand binding protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.988459 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2605  single-strand binding protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.678699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 161 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  32.93 
 
 		 110 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 137 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  34.18 
 
 		 180 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 156 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 156 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  30.71 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  35 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 143 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  29.55 
 
 		 156 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  32.29 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  32.29 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  36.49 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  27.1 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  33.75 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  29.29 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  34.88 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  34.57 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  34.57 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  37.35 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  26.77 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  31 
 
 		 155 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  35.8 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 176 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 168 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  25.45 
 
 		 130 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  32.91 
 
 		 180 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  33.7 
 
 		 172 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  35.14 
 
 		 120 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  27.73 
 
 		 157 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  32.47 
 
 		 234 aa  42  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 164 aa  42  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 181 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  36.99 
 
 		 191 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 120 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>