67 genes were found for organism Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Paes_2339  CDS  NC_011061  786  786  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002019684  normal  0.0896384  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2340  CDS  NC_011061  840  1253  414  hypothetical protein  YP_002019685  normal  0.0506853  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2341  CDS  NC_011061  1471  1893  423  hypothetical protein  YP_002019686  normal  0.186699  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2342  CDS  NC_011061  1890  2453  564  conjugal transfer protein precursor  YP_002019687  normal  0.131603  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2343  CDS  NC_011061  2450  4372  1923  hypothetical protein  YP_002019688  normal  0.666079  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2344  CDS  NC_011061  4374  6545  2172  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_002019689  normal  0.743545  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2345  CDS  NC_011061  6542  7015  474  hypothetical protein  YP_002019690  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2346  CDS  NC_011061  7224  8201  978  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  YP_002019691  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2347  CDS  NC_011061  8373  8675  303  Conjugal transfer protein TrbC  YP_002019692  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2348  CDS  NC_011061  8672  8923  252  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_002019693  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2349  CDS  NC_011061  8929  11391  2463  conjugal transfer ATPase TrbE  YP_002019694  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2350  CDS  NC_011061  11408  12166  759  P-type conjugative transfer protein TrbJ  YP_002019695  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2351  CDS  NC_011061  12188  12382  195  hypothetical protein  YP_002019696  normal  0.689687  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2352  CDS  NC_011061  12401  13591  1191  P-type conjugative transfer protein TrbL  YP_002019697  normal  0.366259  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2353  CDS  NC_011061  13629  14321  693  Conjugal transfer protein  YP_002019698  normal  0.744768  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2354  CDS  NC_011061  14328  15266  939  P-type conjugative transfer protein TrbG  YP_002019699  normal  0.557351  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2355  CDS  NC_011061  15285  16571  1287  conjugation TrbI family protein  YP_002019700  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2356  CDS  NC_011061  16592  16867  276  hypothetical protein  YP_002019701  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2357  CDS  NC_011061  16857  17816  960  hypothetical protein  YP_002019702  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2358  CDS  NC_011061  18204  18719  516  hypothetical protein  YP_002019703  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2359  CDS  NC_011061  19514  19657  144  hypothetical protein  YP_002019704  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2360  CDS  NC_011061  19926  20183  258  hypothetical protein  YP_002019705  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2361  CDS  NC_011061  20352  21032  681  protein of unknown function DUF159  YP_002019706  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2362  CDS  NC_011061  21037  21303  267  hypothetical protein  YP_002019707  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2363  CDS  NC_011061  21882  22709  828  domain of unknown function DUF1738  YP_002019708  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2364  CDS  NC_011061  22781  23110  330  hypothetical protein  YP_002019709  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2365  CDS  NC_011061  23218  23481  264  hypothetical protein  YP_002019710  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2366  CDS  NC_011061  23656  25647  1992  hypothetical protein  YP_002019711  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2367  CDS  NC_011061  25714  27243  1530  putative transcriptional regulator  YP_002019712  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2368  CDS  NC_011061  27352  27720  369  nuclease (SNase domain protein)  YP_002019713  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2369  CDS  NC_011061  28012  29352  1341  hypothetical protein  YP_002019714  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2370  CDS  NC_011061  29361  30293  933  hypothetical protein  YP_002019715  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2371  CDS  NC_011061  30308  30652  345  hypothetical protein  YP_002019716  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2372  CDS  NC_011061  30785  32176  1392  Radical SAM domain protein  YP_002019717  normal  0.545422  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2373  CDS  NC_011061  32257  32535  279  protein of unknown function nitrogen fixation  YP_002019718  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2374  CDS  NC_011061  33094  33591  498  DNA repair protein RadC  YP_002019719  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2375  CDS  NC_011061  33695  34201  507  hypothetical protein  YP_002019720  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2376  CDS  NC_011061  34362  34673  312  hypothetical protein  YP_002019721  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2377  CDS  NC_011061  34705  34815  111  hypothetical protein  YP_002019722  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2378  CDS  NC_011061  35042  36319  1278  DNA-directed DNA polymerase  YP_002019723  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2379  CDS  NC_011061  36661  37887  1227  hypothetical protein  YP_002019724  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2380  CDS  NC_011061  38085  40442  2358  TPR repeat-containing protein  YP_002019725  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2381  CDS  NC_011061  40562  41152  591  Resolvase domain  YP_002019726  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2382  CDS  NC_011061  41349  43652  2304  hypothetical protein  YP_002019727  normal  0.507042  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2383    NC_011061  43753  43980  228      normal  0.0307243  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2384  CDS  NC_011061  43958  44116  159  hypothetical protein  YP_002019728  normal  0.0394212  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2385  CDS  NC_011061  44168  44959  792  protein of unknown function DUF323  YP_002019729  normal  0.0211254  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2386  CDS  NC_011061  45121  45417  297  hypothetical protein  YP_002019730  normal  0.0129206  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2387  CDS  NC_011061  45728  46741  1014  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_002019731  normal  0.0908163  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2388  CDS  NC_011061  46738  47100  363  hypothetical protein  YP_002019732  hitchhiker  0.00873498  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2389  CDS  NC_011061  47072  47551  480  HRDC domain protein  YP_002019733  hitchhiker  0.00782298  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2390  CDS  NC_011061  47801  48682  882  protein of unknown function DUF323  YP_002019734  normal  0.0264886  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2391    NC_011061  48899  49270  372      hitchhiker  0.000720739  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2392  CDS  NC_011061  49386  49979  594  Resolvase domain  YP_002019735  hitchhiker  0.000064315  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2393  CDS  NC_011061  50121  50426  306  hypothetical protein  YP_002019736  hitchhiker  0.00000473432  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2394  CDS  NC_011061  50731  51606  876  hypothetical protein  YP_002019737  unclonable  0.0000000000000539888  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2395    NC_011061  51610  53222  1613      unclonable  0.0000000000107521  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2396  CDS  NC_011061  53219  54352  1134  anticodon nuclease  YP_002019738  unclonable  0.000000000000459061  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2397  CDS  NC_011061  54349  55602  1254  restriction modification system DNA specificity domain  YP_002019739  hitchhiker  0.000238697  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2398  CDS  NC_011061  55595  58642  3048  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  YP_002019740  normal  0.632036  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2399  CDS  NC_011061  59144  59344  201  hypothetical protein  YP_002019741  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2400  CDS  NC_011061  59409  61358  1950  TPR repeat-containing protein  YP_002019742  normal  0.179753  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2401  CDS  NC_011061  61380  61688  309  hypothetical protein  YP_002019743  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2402  CDS  NC_011061  61728  62444  717  alpha-helical coiled-coil protein  YP_002019744  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2403  CDS  NC_011061  63095  63316  222  CopG domain protein DNA-binding domain protein  YP_002019745  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2404  CDS  NC_011061  63336  64160  825  plasmid encoded RepA protein  YP_002019746  normal  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Paes_2405  CDS  NC_011061  65930  66112  183  hypothetical protein  YP_002019747  normal  0.0736301  n/a    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>